Het belangrijkste doel van Metamorfoze is, zorg dragen voor een optimaal behoud van het papieren erfgoed. Om dit te bereiken hanteert Metamorfoze verschillende methoden:
Behandeling van de originelen
Om de papieren originelen beter en langer te kunnen bewaren, vinden er behoudswerkzaamheden en kleine reparaties plaats. In sommige gevallen stelt Metamorfoze ook subsidie beschikbaar voor ontzuring en behandeling van inktvraat en kopervraat. In principe worden individuele stukken niet gerestaureerd, tenzij dit noodzakelijk is voor de digitalisering. Bij de conserverende handelingen horen ook het zuurvrij verpakken en het geklimatiseerd opslaan van het origineel.
Digitale kopie voor gebruik
De kwetsbare originelen worden aan het gebruik onttrokken door de informatie van het materiaal over te zetten op een andere drager. Dit gebeurt door middel van duurzame digitale conversie, preservation imaging. Van het origineel wordt een digitale kopie gemaakt. De informatie is dan op een digitale drager beschikbaar, zodat de papieren originelen niet meer geraadpleegd hoeven te worden.
Onderzoek papierconservering
Om tot de beste oplossingen te komen voor het behoud en de behandeling van originele papieren documenten wordt in opdracht van Bureau Metamorfoze aan onderzoek gedaan. Daarvoor is de werkgroep GezOnd (Gezamenlijk Onderzoek) opgericht, een samenwerkingsverband van Metamorfoze, de Koninklijke Bibliotheek, het Nationaal Archief en de Rijksdienst voor het Cultureel Erfgoed. Zij doen conserveringsonderzoek naar aanleiding van vragen van Bureau Metamorfoze en restauratoren in het veld, en op basis van het Waarderingsmodel Conserveringsonderzoek Papier dat de werkgroep in 2004 opstelde.